وتعرض مرقد الإمامين العسكريين (عليهما السلام) في سامراء الى تفجير مفجع على أيدي التكفيريين سنة 1427 هـ المصادف يوم الأربعاء 22 شباط 2006م 23 محرم، اذ قامت مجموعة ارهابية تكفيرية بتفجير مرقد الأماميين العسكريين في سامراء.
ويشهد مرقد الامامين (ع) بعد ترميمها حركة عمرانية واسعة ونشاطًا كبيرًا إذ يستضيف الآلاف من الزوار شهريًا. وقد شكلت اللجنة الفنية لإعادة إعمار الروضة العسكرية وهي الجهة الوحيدة المخولة بتنفيذ كامل المشروع بمفاصله الإدارية والتقنية والخدمية بتكليف من حكومة العراقية. وقد أكملت بناء القبة في 2015 وبدلت شباك الضريح في 2017.